Odber materiálu - genetika

Odber periférnej krvi

Pre prípravu na odber platia tie isté zásady ako pre klasický venózny odber kap. 3.1.1., avšak nie je nutné, aby sa vykonal odber u pacienta nalačno.

Na cytogenetické a FISH vyšetrenie sa odoberá 5 mℓ periférnej krvi do skúmavky s heparínom lítnym LiH, dôkladne sa uzavrie a premieša. Alternatívou je odber do striekačky prepláchnutej heparínom s následným preliatím do sterilnej skúmavky. Iný protizrážavý roztok ako heparín nie je vhodný! Pri onkohematologických diagnózach je nutné určiť a napísať počet leukocytov v danom odbere. Do transportu a počas neho sa vzorka uchováva pri teplote 4 – 10 °C.

Odberové dni: onkologickí pacienti pondelok – piatok, neonkologickí pacienti pondelok, utorok a piatok.

Na molekulové vyšetrenie sa odoberá 5 mℓ periférnej krvi do sterilnej skúmavky s roztokom EDTA. V prípade, že čas, ktorý uplynie medzi odberom a doručením do laboratória, je väčší ako 24 hodín, je potrebné vzorku zmiešať so špeciálnym roztokom (RNA later) zabraňujúcim degradácii nukleových kyselín. Premieša sa a do transportu a počas neho sa uchováva pri teplote 4 – 10 °C.

Odberové dni: pondelok – piatok

Odber kostnej drene

Kostná dreň na cytogenetické a FISH vyšetrenie sa odoberá do skúmavky s 2 mℓ odberového a transportného média IMDM. Vhodné skúmavky na odber vám na vyžiadanie dodá Centrálne laboratórium - oddelenie lekárskej genetiky. Skúmavky je potrebné skladovať v mrazničke. Tesne pred odberom sa skúmavky rozmrazia a zohrejú na teplotu tela (cca 37°C). Odoberá sa 5 mℓ kostnej drene (resp. podľa možností, minimálne 2 mℓ) do striekačky prepláchnutej heparínom, následne sa biologický materiál premiestni do skúmavky s rozmrazeným médiom, dôkladne sa uzavrie a premieša. Iný protizrážavý roztok nie je vhodný! Je nutné určiť a napísať počet leukocytov v danom odbere. Do transportu je nutné biologický materiál uchovávať pri teplote 4 – 10 °C.

Na molekulové vyšetrenie sa odoberá 5 mℓ (resp. podľa možností, minimálne 2 mℓ) neheparinizovanej kostnej drene do sterilnej skúmavky s 0,5 mℓ 0,05M roztoku EDTA. Vzorka sa premieša a do transportu uchováva pri teplote 4 – 10 °C. V prípade, že čas, ktorý uplynie medzi odberom a doručením do laboratória, je dlhší ako 24 hodín, je potrebné vzorku zmiešať so špeciálnym roztokom zabraňujúcim degradácii DNA ( RNA later). Skúmavky s týmto roztokom vám na vyžiadanie dodá Centrálne laboratórium - oddelenie lekárskej genetiky.

Odber nefixovaného tkaniva

Na cytogenetické a FISH vyšetrenie sa odoberá 5 mℓ kostnej drene (resp. podľa možností, minimálne 2 mℓ) do skúmavky s heparínom lítnym LiH, prípadne do striekačky prepláchnutej heparínom. Po dôkladnom premiešaní sa vzorka premiestni do 2 mℓ odberového a transportného média IMDM zohriateho na 37°C.  Vhodné skúmavky na odber Vám na vyžiadanie dodá Centrálne laboratórium - oddelenie lekárskej genetiky. Skúmavky s transportným médiom je potrebné skladovať v mrazničke. Tesne pred odberom sa skúmavky rozmrazia a zohrejú na teplotu tela (cca 37°C). Iný protizrážavý roztok ako LiH nie je vhodný! Je nevyhnutné určiť a napísať počet leukocytov v danom odbere. Do transportu je nutné  biologický materiál uchovávať pri teplote 4 – 10 °C.

Odberové dni: pondelok – štvrtok

Na molekulové vyšetrenie sa odoberá 5 mℓ (resp. podľa možností, minimálne 2 mℓ) kostnej drene do sterilnej skúmavky s  roztokom EDTA. V prípade, že čas, ktorý uplynie medzi odberom a doručením do laboratória, je väčší ako 24 hodín, je potrebné vzorku zmiešať so špeciálnym roztokom (RNA later) zabraňujúcim degradácii nukleových kyselín. Vzorka sa premieša a do transportu a počas neho uchováva pri teplote 4 – 10 °C. Skúmavky s týmto roztokom Vám na vyžiadanie dodá Centrálne laboratórium - oddelenie lekárskej genetiky.

Odberové dni: pondelok – piatok

Odber nefixovaného tkaniva (choriové klky, tkanivo z plodu po aborte, nádorové tkanivo)

Na cytogenetické a FISH vyšetrenie sa odoberá minimálne 0,5 - 1 cm3 alebo cca 20 – 100 mg nefixovaného tkaniva do sterilnej skúmavky s fyziologickým roztokom (platí pre nádorové tkanivo), kultivačným médiom RPMI 1640 alebo Amniogrow (platí pre nenádorové tkanivo). Aj nenádorové tkanivo je možné odoberať a transportovať vo fyziologickom roztoku. Potrebné skúmavky na vyžiadanie dodá Centrálne laboratórium. Skúmavky s kultivačným médiom sa skladujú v mrazničke. Tesne pred odberom je potrebné skúmavky rozmraziť a zohriať na 37°C.

Odberové dni: utorok a streda

Na molekulové vyšetrenie sa odoberá minimálne 0,5 - 1 cm3 nefixovaného tkaniva do skúmavky s fyziologickým roztokom. Do transportu a počas neho je potrebné biologický materiál uchovávať pri teplote 4 – 10 °C.

Odberové dni: pondelok – piatok

Parafínové rezy

Fixované nádorové tkanivo je možné po narezaní na ultratenké rezy vyšetriť FISH metódou. Patológom zhodnotené a označené vzorky v parafínovom bločku sa narežú na rezy hrubé 4 – 5 μm a fixujú sa na silanizované podložné sklá (minimum 3). Takto zhotovené sklíčka sa do prevozu uchovávajú pri laboratórnej teplote.

Odberové dni: pondelok – piatok

Nádorové tkanivo fixované v parafínových bločkoch

Nádorové tkanivo sa na patológii bežnými postupmi spracuje a fixuje v parafínových bločkoch. Takto pripravené parafínové preparáty sa skladujú a transportujú pri laboratórnej teplote. Na oddelení genetiky môžu byť parafínové preparáty spracované metódami FISH a lebo molekulovou analýzou. Minimálne množstvo materiálu na genetickú analýzu je 0,5 cm³.

Odber plodovej vody

Za účelom komplexnej genetickej analýzy sa odoberá cca 20 – 24 mℓ plodovej vody do dvoch až troch sterilných a riadne označených skúmaviek, pričom prvé 1-2 mℓ je potrebné odstrániť, aby sa zabránilo kontaminácii materskými bunkami. Takto odobratý materiál sa udržiava pri laboratórnej teplote a je nutné ho bezprostredne po odbere dopraviť do genetického laboratória.

Odberové dni: utorok a streda

Pri požiadavke rýchlej diagnostiky metódou QF PCR sa odoberá 2 – 5 ml plodovej vody do sterilnej skúmavky. Dôležité je, aby materiál nebol kontaminovaný materskou DNA. Materiál sa do transportu uchováva pri teplote 4 – 10°C.

Odberové dni: pondelok – piatok